生物潔凈安全柜認可樣品和工作人員的雙重保護。過濾后的潔凈氣流從安全柜頂部吹下，通過工作區域,在到工作人員的呼吸區域前被俘獲。氣流在放將被過濾，一般情況下過濾后的空氣將被排回實驗室或者通過排氣管道排出室外。是對試驗樣品和試驗工作人員起空氣環境清潔的作用，操作時要注意生物潔凈安全柜擺放的位置和常見故障。
生物潔凈安全柜的作用是為操作原代培養物、菌毒株以及診斷性標本等具有感染性的實驗材料時,用來保護操作者本人、實驗室環境以及實驗材料,使其避免暴露于上述操作過程中可能產生的感染性氣溶膠和濺出物而設計的。但是日常生活中我發現許多人對于它的認知還有存在一定誤區的：
 誤區一：百級凈化工作臺生物潔凈安全柜
大多數人覺得這兩種設備外形相同，作用肯定也是大同小異，并認為他們操作的樣本都是普通的樣本，不具有高致病性。其實，生物潔凈安全柜和百級凈化工作臺具有本質的差別：
(1)百級凈化工作臺將通過高效過濾器的凈化空氣向下吹過工作區，用來保護樣品，由于工作區是正壓區，氣流通過操作窗口外溢，只保護樣品，而對操作人員和環境不保護，如操作含有任何已知或潛在致病氣溶膠，都會給操作人員帶來大隱患。
(2)生物潔凈安全柜是一種負壓凈化工作臺，可以防止操作者和環境暴露于實驗室過程中產生的有害氣溶膠，是傳染性微生物的牢籠，正確地操作生物安全柜，能夠保護操作人員、樣品、工作環境。因此，醫院臨床檢驗、診斷、病理分析、腫瘤藥物的配制等工作及相關生物醫學所、實驗室都應使用生物安全柜。
目前用潔凈工作臺生物安全柜的這種局面應盡快改變，否則，給廣大醫護人員、實驗科研人員帶來大的隱患。
誤區二：生物安全柜的選用誤區
生物安全柜選型不當，根據結構設計、排風比例和保護對象和程度不同，生物安全柜分為Ⅰ級、Ⅱ級和Ⅲ級，其中Ⅱ級又分為A2、B2型。不同的生物安全實驗室應選用不同的生物安全柜，也可根據要保護、防護的不同類型來選擇適當的安全柜。怎樣選擇合適的安全柜在之前的文章中已經詳細介紹過，這里就補多少了。
誤區三：生物安全柜監控成空白
現在生物安全柜大量應用在醫療衛生、疾病預防與控制、食品衛生、生物制藥，環境監測以及各級實驗室等領域，是保障生物安全和環境安全的重要物質基礎，是屬于“民生”計量的范疇。
目前大多數用戶對生物安全柜的檢測性能不夠了解，不少用戶認為只要生物安全柜能轉，就一直用下去，使之成為很大的隱患。其實生物安全柜在安裝完畢、移動位置后、檢修后、更換高效過濾器后都必須進行現場重新檢測;另外，還應進行一年一度的常規檢查及安全評估才能真的沒有后顧之憂的使用。
生物潔凈安全柜位置的擺放：從生物潔凈安全柜前臉的開口流入柜內的氣流速度約為０．４５米／秒。以這一風速，柜內單向流的一致性易受干擾，很容易被安全柜附近人員的走動、開窗、送風配風器、門的開關所干擾。按理想的布置，應放在遠離活動及可能有干擾氣流的地方。應盡量在安全柜的后側及兩側留下３０厘米的空間，便于維護作業。柜子上方則留下３０～３５厘米的高度，以便對排風過濾器的風速進行測量，并為排風過濾器的更換留下足夠空間。